タンパク質機能・構造研究チーム|理化学研究所 生命機能科学研究センター(BDR)

タンパク質機能・構造研究チーム

チームリーダー

白水 美香子Ph.D.

研究室主宰者の写真

  • 拠点:横浜
  • E-mail:
    mikako.shirouzu[at]riken.jp[at]を@に変えてください

創薬・医療等のライフイノベーションに貢献する構造解析技術基盤を構築

研究内容

個別化医療を実現する薬の開発においては、ターゲットとなる疾患に関与するタンパク質の機能と構造の情報の蓄積が一層重要となります。これまで解析が難しかった膜タンパク質をはじめとする高難度タンパク質の試料調製法や、生体分子複合体のクライオ電子顕微鏡による解析技術の開発を進めながら、創薬・医療等のライフイノベーションに貢献する構造解析技術の基盤を構築します。立体構造情報は、候補化合物のインシリコスクリーニングや動的構造計算に供され、創薬への貢献や、細胞機能のシミュレーション研究へと発展することが期待されます。

クライオ電子顕微鏡

クライオ電子顕微鏡

研究テーマ

  • 創薬を目指したタンパク質の立体構造解析
  • 膜タンパク質などの高難度タンパク質調製技術の開発
  • クライオ電子顕微鏡による巨大な生体分子複合体の立体構造解析

主要論文

  • Zyryanova AF, Kashiwagi K, Rato C, et al.
    ISRIB blunts the integrated stress response by allosterically antagonising the inhibitory effect of phosphorylated eIF2 on eIF2B.
    Molecular Cell (2020)doi: 10.1016/j.molcel.2020.10.031
  • Needham D M, Yoshizawa S, Hosaka T, et al.
    A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators.
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 116(41), 20574-20583 (2019) doi: 10.1073/pnas.1907517116.
  • Lee Y, Wiriyasermkul P, Jin C, et al.
    Cryo-EM structure of the human L-type amino acid transporter 1 in complex with glycoprotein CD98hc.
    Nature Structural & Molecular Biology 26(6), 510-517 (2019) doi: 10.1038/s41594-019-0237-7
  • Yokoyama T, Machida K, Iwasaki W, et al.
    HCV IRES Captures an Actively Translating 80S Ribosome.
    Molecular Cell 74(6), 1205-1214 e1208 (2019) doi: 10.1016/j.molcel.2019.04.022.
  • Kashiwagi K, Yokoyama T, Nishimoto M, et al.
    Structural basis for eIF2B inhibition in integrated stress response.
    Science 364(6439), 495-499 (2019) doi: 10.1126/science.aaw4104.
  • Ehara H, Kujirai T, Fujino Y, et al.
    Structural insight into nucleosome transcription by RNA polymerase II with elongation factors.
    Science 363(6428), 744-747 (2019) doi: 10.1126/science.aav8912.
  • Kujirai T, Ehara H, Fujino Y, et al.
    Structural basis of the nucleosome transition during RNA polymerase II passage.
    Science 362(6414). 595-598 (2018) doi: 10.1126/science.aau9904
  • Shigematsu H, Imasaki T, Doki C, et al.
    Structural insight into microtubule stabilization and kinesin inhibition by Tau-family MAPs.
    The Journal of Cell Biology 217(12).4155-4163 (2018) doi: 10.1083/jcb.201711182
  • Shima T, Morikawa M, Kaneshiro J, et al.
    Kinesin-binding–triggered conformation switching of microtubules contributes to polarized transport.
    The Journal of Cell Biology 217(12).4164-4183 (2018) doi: 10.1083/jcb.201711178
  • Yamagata A, Miyazaki Y, Yokoi N, et al.
    Structural basis of epilepsy-related ligand–receptor complex LGI1–ADAM22.
    Nature communications 9(1). 1546 (2018) doi: 10.1038/s41467-018-03947-w
  • Matsuda T, Ito T, Takemoto C, et al.
    Cell-free synthesis of functional antibody fragments to provide a structural basis for antibody-antigen interaction.
    PLoS One 13(2). e0193158(2018) doi: 10.1371/journal.pone.0193158

業績一覧