タンパク質機能・構造研究チーム|理化学研究所 生命機能科学研究センター(BDR)

タンパク質機能・構造研究チーム

チームリーダー

白水 美香子Ph.D.

  • 拠点:横浜
  • E-mail:
    mikako.shirouzu[at]riken.jp[at]を@に変えてください

創薬・医療等のライフイノベーションに貢献する構造解析技術基盤を構築

研究内容

個別化医療を実現する薬の開発においては、ターゲットとなる疾患に関与するタンパク質の機能と構造の情報の蓄積が一層重要となります。これまで解析が難しかった膜タンパク質をはじめとする高難度タンパク質の試料調製法や、生体分子複合体のクライオ電子顕微鏡による解析技術の開発を進めながら、創薬・医療等のライフイノベーションに貢献する構造解析技術の基盤を構築します。立体構造情報は、候補化合物のインシリコスクリーニングや動的構造計算に供され、創薬への貢献や、細胞機能のシミュレーション研究へと発展することが期待されます。

クライオ電子顕微鏡

クライオ電子顕微鏡

研究テーマ

  • 創薬を目指したタンパク質の立体構造解析
  • 膜タンパク質などの高難度タンパク質調製技術の開発
  • クライオ電子顕微鏡による巨大な生体分子複合体の立体構造解析

主要論文

  • Kujirai T, Ehara H, Fujino Y, et al.
    Structural basis of the nucleosome transition during RNA polymerase II passage.
    Science (2018) doi: 10.1126/science.aau9904
  • Shigematsu H, Imasaki T, Doki C, et al.
    Structural insight into microtubule stabilization and kinesin inhibition by Tau-family MAPs.
    The Journal of Cell Biology (2018) doi: 10.1083/jcb.201711182
  • Matsuda T, Ito T, Takemoto C, et al.
    Cell-free synthesis of functional antibody fragments to provide a structural basis for antibody-antigen interaction.
    PLoS One 13(2) e0193158 (2018) doi:10.1371/journal.pone.0193158
  • Shoji S, Hanada K, Ohsawa N, Shirouzu M.
    Central catalytic domain of BRAP (RNF52) recognizes the types of ubiquitin chains and utilizes oligo-ubiquitin for ubiquitylation.
    Biochemical Journal 474(18). 3207-3226 (2017) doi:10.1042/BCJ20161104
  • Niwa S, Nakamura F, Tomabechi Y, et al.
    Structural basis for CRMP2-induced axonal microtubule formation.
    Scientific Reports 7(1). 10681 (2017) doi:10.1038/s41598-017-11031-4
  • Ehara H, Yokoyama T, Shigematsu H, et al.
    Structure of the complete elongation complex of RNA polymerase II with basal factors.
    Science 357(6354). 921-924 (2017) doi:10.1126/science.aan8552
  • Katsura K, Matsuda T, Tomabechi Y, et al.
    A reproducible and scalable procedure for preparing bacterial extracts for cell-free protein synthesis.
    The Journal of Biochemistry 162(5). 357-369 (2017) doi:10.1093/jb/mvx039
  • Hosaka T, Okazaki M, Kimura-Someya T, et al.
    Crystal structural characterization reveals novel oligomeric interactions of human voltage-dependent anion channel 1.
    Protein Science 26(9). 1749-1758 (2017) doi:10.1002/pro.3211
  • Shinoda T, Shinya N, Ito K, et al.
    Structural basis for disruption of claudin assembly in tight junctions by an enterotoxin.
    Scientific Reports 6. 33632 (2016) doi:10.1038/srep33632
  • Masuda M, Uno Y, Ohbayashi N, et al.
    TNIK inhibition abrogates colorectal cancer stemness.
    Nature Communications 7. 12586 (2016) doi:10.1038/ncomms12586

業績一覧