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 関根 俊一チームリーダーの写真

チームリーダー
関根 俊一 Ph.D.

転写制御構造生物学研究チーム

拠点横浜

E-mail shunichi.sekine[at]riken.jp

[at]を@に変えてください

大学院生募集中

生命活動を支える分子のはたらく姿をとらえ、生命の理解に迫る

生命活動は、生体を構成するタンパク質や核酸といった分子が集合したり、協調して働いたりすることで支えられています。その姿を可視化し、働く仕組みを明らかにするために、当チームでは、巨大な生体分子複合体の調製法を確立し、クライオ電子顕微鏡やSPring-8/SACLA の放射光を駆使して、それらの立体構造の解明を行なっています。特に、RNA ポリメラーゼと転写関連因子の複合体のような巨大複合体を解析し、転写やそれに関連する重要な現象の背後にある分子メカニズムを高分解能で解き明かします。

また、ウイルスや細菌が持つ複製・転写系のタンパク質は主要な創薬のターゲットのひとつであり、それらの立体構造解析により、創薬研究の基礎となる構造基盤を提供します。

研究テーマ

  • RNAの転写およびそれに関連した生命現象の分子メカニズムの解明
  • 超分子複合体の調製・解析技術の高度化
  • ウイルスや細菌の複製・転写機構の解明と創薬への応用

主要論文

Sekine S, Ehara H, Kujirai T, et al.
Structural perspectives on transcription in chromatin
Trends in Cell Biology Thu Aug 17 00:00:00 JST 2023 doi: 10.1016/j.tcb.2023.07.011

Osawa T, Aoki M, Ehara H, et al.
Structures of dengue virus RNA replicase complexes
Molecular Cell Wed Jul 12 00:00:00 JST 2023 doi: 10.1016/j.molcel.2023.06.023

Murayama Y, Ehara H, Aoki M, et al.
Structural basis of the transcription termination factor Rho engagement with transcribing RNA polymerase from Thermus thermophilus
Science Advances 9(6), eade7093 Fri Feb 10 00:00:00 JST 2023 doi: 10.1126/sciadv.ade7093

Hirano R, Ehara H, Kujirai T, et al.
Structural basis of RNA polymerase II transcription on the chromatosome containing linker histone H1
Nature Communications 13, 7287 Sat Nov 26 00:00:00 JST 2022 doi: 10.1038/s41467-022-35003-z

Ehara H, Kujirai T, et al.
Structural basis of nucleosome disassembly and reassembly by RNAPII elongation complex with FACT
Science 377(6611), abp9466 Thu Aug 18 00:00:00 JST 2022 doi: 10.1126/science.abp9466

Sekine S, Uejima T, Ehara H.
RNA Polymerase-associated Transcription Elongation Factors
RNA Polymerases as Molecular Motors 2nd ed, Chapter 4 Wed Dec 15 00:00:00 JST 2021 doi: 10.1039/9781839160561-00072

Ehara H, Kujirai T, et al.
Structural insight into nucleosome transcription by RNA polymerase II with elongation factors.
Science 363(6428), 744-747 Sun Dec 01 00:00:00 JST 2019 doi: 10.1126/science.aav8912

Shimizu H, Saito A, Mikuni J, et al.
Discovery of a small molecule inhibitor targeting dengue virus NS5 RNA-dependent RNA polymerase.
Plos Neglected Tropical Diseases 13(11), e0007894 Fri Nov 01 00:00:00 JST 2019 doi: 10.1371/journal.pntd.0007894

Kujirai T, Ehara H, et al.
Structural basis of the nucleosome transition during RNA polymerase II passage.
Science 362(6414), 595-598 Sat Dec 01 00:00:00 JST 2018 doi: 10.1126/science.aau9904

Ooi WY, Murayama Y, Mekler V, et al.
A Thermus phage protein inhibits host RNA polymerase by preventing template DNA strand loading during open promoter complex formation.
Nucleic Acids Research 46(1), 431-441 Fri Dec 01 00:00:00 JST 2017 doi: 10.1093/nar/gkx1162

Ehara H, Yokoyama T, Shigematsu H, et al.
Structure of the complete elongation complex of RNA polymerase II with basal factors.
Science 357(6354), 921-924 Wed Nov 01 00:00:00 JST 2017 doi: 10.1126/science.aan8552

Sekine S, Murayama Y, Svetlov V, et al.
Ratcheting of RNA polymerase toward structural principles of RNA polymerase operations.
Transcription 6(3), 56-60 Tue Dec 01 00:00:00 JST 2015 doi: 10.1080/21541264.2015.1059922

Sekine S, Murayama Y, Svetlov V, et al.
The ratcheted and ratchetable structural states of RNA polymerase underlie multiple transcriptional functions.
Molecular Cell 57(3), 408-421 Sun Nov 01 00:00:00 JST 2015 doi: 10.1016/j.molcel.2014.12.014

Tagami S, Sekine S, Minakhin L, et al.
Structural basis for promoter specificity switching of RNA polymerase by a phage factor.
Genes & Development 28(5), 521-531 Sat Nov 01 00:00:00 JST 2014 doi: 10.1101/gad.233916.113

Tagami S, Sekine S, Kumarevel T, et al.
Crystal structure of bacterial RNA polymerase bound with a transcription inhibitor protein.
Nature 468(7326), 978-982 Wed Dec 01 00:00:00 JST 2010 doi: 10.1038/nature09573

メンバー

 関根 俊一チームリーダーの写真

チームリーダー関根 俊一

  • shunichi.sekine[at]riken.jp
    ([at]を@に置き換えてください)
  • CV

関根 俊一

チームリーダー

THIRUMANANSERI Kumarevel

専任研究員

江原 晴彦

上級研究員

大澤 拓生

研究員

柳沢 達男

研究員

永沼 政広

研究員

村山 祐子

上級テクニカルスタッフ

五島 美絵

テクニカルスタッフⅠ

青木 真理

テクニカルスタッフⅠ

邉見 真生

テクニカルスタッフⅡ

工藤 朋子

アシスタント

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