生体分子が機能する際には、その構造ダイナミクスが重要な鍵となります。生体分子動態デザイン研究チームでは、タンパク質デザインと分子シミュレーションの手法を組み合わせて、膜タンパク質・ペプチドを中心に構造ダイナミクスが制御可能な生体分子を設計する技術を確立し、設計分子の構造・機能解析を通して生体内で機能する仕組みを解明することを目指しています。また化学の視点を取り入れて設計分子を機能開拓することで、細胞動態の摂動・イメージングツール、バイオセンサーなどを創出し生命科学研究に役立てていきます。
主要論文
Tan C, Niitsu A, Sugita Y.
Highly Charged Proteins and Their Repulsive Interactions Antagonize Biomolecular Condensation.
Journal of American Chemical Society Au
3(3), 834-848 Mon Mar 27 00:00:00 JST 2023
doi: 10.1021/jacsau.2c00646
Niitsu A, Sugita Y.
Towards de novo design of transmembrane α-helical assemblies using structural modelling and molecular dynamics simulation.
Physical Chemistry Chemical Physics
25(5), 3595-3606 Wed Feb 01 00:00:00 JST 2023
doi: 10.1039/d2cp03972a
Scott AJ, Niitsu A, Kratochvil HT, et al.
Constructing ion channels from water-soluble α-helical barrels.
Nature Chemistry
13(7), 643-650 Thu Jul 01 00:00:00 JST 2021
doi: 10.1038/s41557-021-00688-0
Niitsu A, Re S, Oshima H, et al.
De Novo Prediction of Binders and Nonbinders for T4 Lysozyme by gREST Simulations.
Journal of Chemical Information and Modeling
59(9), 3879-3888 Mon Sep 23 00:00:00 JST 2019
doi: 10.1021/acs.jcim.9b00416
Niitsu A, Egawa A, Ikeda K, et al.
Veratridine binding to a transmembrane helix of sodium channel Nav1.4 determined by solid-state NMR.
Bioorganic & Medicinal Chemistry
26(21), 5644-5653 Thu Nov 15 00:00:00 JST 2018
doi: 10.1016/j.bmc.2018.10.012
Thomas F, Niitsu A, Oregioni A, et al.
Conformational Dynamics of Asparagine at Coiled-Coil Interfaces.
Biochemistry
56(50), 6544-6554 Tue Dec 19 00:00:00 JST 2017
doi: 10.1021/acs.biochem.7b00848
Niitsu A, Heal JW, Fauland K, et al.
Membrane-spanning α-helical barrels as tractable protein-design targets.
Philosophical Transactions of the Royal Society B
372(1726), 20160213 Sat Aug 05 00:00:00 JST 2017
doi: 10.1098/rstb.2016.0213
Mahendran KR, Niitsu A, Kong L, et al.
A monodisperse transmembrane α-helical peptide barrel.
Nature Chemistry
9(5), 411-419 Mon May 01 00:00:00 JST 2017
doi: 10.1038/nchem.2647
メンバー
新津 藍
チームリーダー
