超微形態研究チームは、細胞のかたちと働きの関係を解き明かすことを目指し、電子顕微鏡による微細構造解析を軸に研究を展開しています。細胞内構造は遺伝子変化や細胞間相互作用、環境に応じて動的に変化し、その乱れは機能異常や病態につながります。
私たちは、細胞分化に伴う形態変化やゴルジ体関連分解GOMEDの生理的役割、新しい細胞死機構の解明に取り組み、細胞構造の変化が細胞や組織機能に与える影響を明らかにします。さらに、病態に伴って組織内に出現する封入体や結晶構造を組織内で直接解析する新規技術の開発にも取り組み、これらの構造が病態にどのように関わるのかを解き明かします。
主要論文
Nibe-Shirakihara Y, Honda S, Arakawa S, et al.
Optineurin is an adaptor protein for ubiquitinated substrates in Golgi membrane-associated degradation.
Nature Communications
16, 8966 (2025)
doi: 10.1038/s41467-025-64400-3
Yamaguchi H, Honda S, Torii S, et al.
Wipi3 is essential for alternative autophagy and its loss causes neurodegeneration
Nature Communications
11, 5311 (2020)
doi: 10.1038/s41467-020-18892-w
Torii S, Yamaguchi H, Nakanishi A, et al.
Identification of a phosphorylation site on Ulk1 required for genotoxic stress-induced alternative autophagy
Nature Communications
11, 1754 (2020)
doi: 10.1038/s41467-020-15577-2
Arakawa S, Tsujioka M, Yoshida T, et al.
Role of Atg5-dependent cell death in the embryonic development of Bax/Bak double-knockout mice
Cell Death & Differentiation
24(9), 1598-1608 (2017)
doi: 10.1038/cdd.2017.84
Watanabe Y, Honda S, Konishi A, et al.
Autophagy controls centrosome number by degrading Cep63
Nature Communications
7, 13508 (2016)
doi: 10.1038/ncomms13508
Yamaguchi H, Arakawa S, Kanaseki T, et al.
Golgi membrane-associated degradation pathway in yeast and mammals
The EMBO Journal
35(18), 1991-2007 (2016)
doi: 10.15252/embj.201593191
Honda S, Arakawa S, Nishida Y, et al.
Ulk1-mediated Atg5-independent macroautophagy mediates elimination of mitochondria from embryonic reticulocytes
Nature Communications
5, 4004 (2014)
doi: 10.1038/ncomms5004
Narita M, Young A, Arakawa S, et al.
Spatial Coupling of mTOR and Autophagy Augments Secretory Phenotypes
Science
332(6032), 966-970 (2011)
doi: 10.1126/science.1205407
Nishida Y, Arakawa S, Fujitani K, et al.
Discovery of Atg5/Atg7-independent alternative macroautophagy
Nature
461(7264), 654-658 (2009)
doi: 10.1038/nature08455
Shimizu S, Kanaseki T, Mizushima N, et al.
Role of Bcl-2 family proteins in a non-apoptotic programmed cell death dependent on autophagy genes
Nature Cell Biology
6(12), 1221-1228 (2004)
doi: 10.1038/ncb1192
