高機能生体分子開発チームでは合成生物学・構造生物学的手法を用いて機能性生体高分子の開発に取り組んでいます。具体的には、ペプチド・RNA の試験管内進化、タンパク質のX 線結晶構造解析などの技術を組み合わせることで細胞の動態を制御する分子を作成し、医療や基礎生物学への応用を目指しています。さらに、同様の技術を活用して、生命誕生からのタンパク質の進化過程の再現にも挑戦しています。
研究テーマ
- 生体内の標的分子の機能を調整するペプチドを試験管内進化実験によって開発し、医療や基礎生物学への応用を目指す。
- 生命誕生時におけるペプチド・タンパク質の進化過程を実験的に再現し、核酸とタンパク質の共進化の歴史を探る。
主要論文
Chaban A, Minakhin L, Goldobina E, et al.
Tail-tape-fused virion and non-virion RNA polymerases of a thermophilic virus with an extremely long tail
Nature Communications
Fri Jan 05 00:00:00 JST 2024
doi: 10.1038/s41467-023-44630-z
Yagi S, Tagami S.
Missing-link fold reveals the evolutionary pathway between RNA polymerase and ribosomal proteins
bioRxiv
Mon Dec 05 00:00:00 JST 2022
doi: 10.1101/2023.07.05.547881
Mohri K, Huynh Nhat KP, Zouda M, et al.
Lasso peptide microcin J25 variant containing RGD motif as a PET probe for integrin αvβ3 in tumor imaging
European Journal of Pharmaceutical Sciences
Thu Nov 24 00:00:00 JST 2022
doi: 10.1016/j.ejps.2022.106339
Alfi A, Popov A, Kumar A, et al.
Cell-Free Mutant Analysis Combined with Structure Prediction of a Lasso Peptide Biosynthetic Protease B2
ACS Synthetic Biology
Wed Jun 08 00:00:00 JST 2022
doi: 10.1021/acssynbio.2c00176
Li P, Holliger P, Tagami S.
Hydrophobic-cationic peptides modulate RNA polymerase ribozyme activity by accretion
Nature Communications
13, 3050 Fri Jun 03 00:00:00 JST 2022
doi: 10.1038/s41467-022-30590-3
Yagi S, Padhi AK, Vucinic J, et al.
Seven Amino Acid Types Suffice to Create the Core Fold of RNA Polymerase.
Journal of the American Chemical Society
Fri Sep 24 00:00:00 JST 2021
doi: 10.1021/jacs.1c05367
Sumida T, Dubiley S, Wilcox B, et al.
Structural Basis of Leader Peptide Recognition in Lasso Peptide Biosynthesis Pathway.
ACS Chemical Biology.,
14(7), 1619-1627 Sun Dec 01 00:00:00 JST 2019
doi: 10.1021/acschembio.9b00348
Tagami S, Attwater J, Holliger P.
Simple peptides derived from the ribosomal core potentiate RNA polymerase ribozyme function.
Nature Chemistry
9, 325-332 Fri Dec 01 00:00:00 JST 2017
doi: 10.1038/nchem.2739
Tagami S, Sekine S, Minakhin L, et al.
Structural basis for promoter specificity switching of RNA polymerase by a phage factor.
Genes & Development
28(5), 521-531 Mon Dec 01 00:00:00 JST 2014
doi: 10.1101/gad.233916.113
Tagami S, Sekine S, Kumarevel T, et al.
Crystal structure of bacterial RNA polymerase bound with a transcription inhibitor protein.
Nature
468(7326), 978-982 Wed Dec 01 00:00:00 JST 2010
doi: 10.1038/nature09573
メンバー
チームリーダー田上 俊輔
- shunsuke.tagami[at]riken.jp
([at]を@に置き換えてください) - CV [PDF size:102KB]