タンパク質機能・構造研究チーム|理化学研究所 生命機能科学研究センター(BDR)

タンパク質機能・構造研究チーム

チームリーダー

白水 美香子Ph.D.

研究室主宰者の写真

  • 拠点:横浜
  • E-mail:
    mikako.shirouzu[at]riken.jp[at]を@に変えてください

創薬・医療等のライフイノベーションに貢献する構造解析技術基盤を構築

研究内容

個別化医療を実現する薬の開発においては、ターゲットとなる疾患に関与するタンパク質の機能と構造の情報の蓄積が一層重要となります。これまで解析が難しかった膜タンパク質をはじめとする高難度タンパク質の試料調製法や、生体分子複合体のクライオ電子顕微鏡による解析技術の開発を進めながら、創薬・医療等のライフイノベーションに貢献する構造解析技術の基盤を構築します。立体構造情報は、候補化合物のインシリコスクリーニングや動的構造計算に供され、創薬への貢献や、細胞機能のシミュレーション研究へと発展することが期待されます。

クライオ電子顕微鏡

クライオ電子顕微鏡

研究テーマ

  • 創薬を目指したタンパク質の立体構造解析
  • 膜タンパク質などの高難度タンパク質調製技術の開発
  • クライオ電子顕微鏡による巨大な生体分子複合体の立体構造解析

主要論文

  • Kukimoto-Niino M, Katsura K, Kaushik R, et al.
    Cryo-EM structure of the human ELMO1-DOCK5 complex.
    Science Advances 7(30). eabg3147 (2021) doi: 10.1126/sciadv.abg3147
  • Kasahara K, Re S, Nawrocki G, et al.
    Reduced Efficacy of a Src Kinase Inhibitor in Crowded Protein Solution.
    Nature Communications 12. 4099 (2021) doi: 10.1038/s41467-021-24349-5
  • Sugizaki A, Sato K, Chiba K, et al.
    POLArIS, a versatile probe for molecular orientation, revealed actin filaments associated with microtubule asters in early embryos.
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 118(11).e2019071118 (2021) doi: 10.1073/pnas.2019071118.
  • Zyryanova AF, Kashiwagi K, Rato C, et al.
    ISRIB blunts the integrated stress response by allosterically antagonising the inhibitory effect of phosphorylated eIF2 on eIF2B.
    Molecular Cell 81(1). 88-103.e6 (2021) doi: 10.1016/j.molcel.2020.10.031
  • Kobayashi H, Hatakeyama H, Nishimura H, et al.
    Chemical reversal of abnormalities in cells carrying mitochondrial DNA mutations.
    Nature Chemical Biology 17(3). 335-343 (2021) doi: 10.1038/s41589-020-00676-4.
  • Ihara K, Hato M, Nakane T, et al.
    Isoprenoid-chained lipid EROCOC17+4: a new matrix for membrane protein crystallization and a crystal delivery medium in serial femtosecond crystallography.
    Scientific Reports 10(1). 19305 (2020) doi: 10.1038/s41598-020-76277-x.
  • Murayama K, Kato-Murayama M, Itoh Y, et al.
    Structural basis for inhibitory effects of Smad7 on TGF-beta family signaling.
    Journal of Structural Biology 212(3). 107661 (2020) doi: 10.1016/j.jsb.2020.107661.
  • Yokoyama T, Machida K, Iwasaki W, et al.
    HCV IRES Captures an Actively Translating 80S Ribosome.
    Molecular Cell 74(6), 1205-1214 e1208 (2019) doi: 10.1016/j.molcel.2019.04.022.
  • Kashiwagi K, Yokoyama T, Nishimoto M, et al.
    Structural basis for eIF2B inhibition in integrated stress response.
    Science 364(6439), 495-499 (2019) doi: 10.1126/science.aaw4104.
  • Kukimoto-Niino M, Tsuda K, Ihara K, et al.
    Structural basis for the dual substrate specificity of DOCK7 guanine nucleotide exchange factor.
    Structure 27(5). 741-748.e3 (2019) doi: 10.1016/j.str.2019.02.001.
  • Ehara H, Kujirai T, Fujino Y, et al.
    Structural insight into nucleosome transcription by RNA polymerase II with elongation factors.
    Science 363(6428), 744-747 (2019) doi: 10.1126/science.aav8912.
  • Matsuda T, Ito T, Takemoto C, et al.
    Cell-free synthesis of functional antibody fragments to provide a structural basis for antibody-antigen interaction.
    PLoS One 13(2). e0193158 (2018) doi: 10.1371/journal.pone.0193158

業績一覧